PEPSİN protein sindiren enzim. Etle beslenen yaratıkların mide mukozasında bulunan salgı bezlerince salgılanır. İri protit moleküllerini kısmen hidroliz yoluyla parçalayarak albümozlar oluşturur.
Salgılanması, alışkanlığa (yemek saati), besinleri görmeye ve koklamaya bağlıdır. Eczacılıkta pepsin, domuzun mide mukozasından maserasyonla ya da asit otoliziyle elde edilir.
Sindirimi uyarıcı ilaç olarak kaşe, granül ya da şurup şeklinde ve genellikle klorhidrik asitle beraber alınır.