MİKROMANİPÜLATÖR mikroskop altında incelenen mikroskobik nesneler üstünde çeşitli işlemler yapmak olanağı veren aygıt. 1888’de Charby tarafından tasarlanan mikromanipülatör, daha sonra Chamhers (1921), Fonbrune (1932-1939 arasında) ve Commandon tarafından geliştirildi.
Bu aygıt her biri bir kumanda şırıngası, bir kauçuk boru ve bir manometre kapsülünden oluşan üç pnömatik kumanda sisteminin bir kol üzerine üç yönden uyguladığı hareketleri manometre kapsüllerinin zarlarına dayanan mikro aletlere (pense, iğne, kesici lama vb.) küçülterek aktarır.
Mikromanipülatör genellikle mikroskopik ameliyatlarda kullanılır.